Forum Komunikasi Perguruan Tinggi Keagamaan Islam Swasta Kopertais Wilayah III Yogyakarta:

1. Universitas Muhammadiyah Yogyakarta
2. Universitas Ahmad Dahlan
3. Universitas Islam Indonesia
4. Universitas Cokro Aminoto Yogyakarta
5. Universitas Alma Ata Yogyakarta
6. IIQ An-Nur Yogyakarta
7. Universitas Nahdlatul Ulama Yogyakarta
8. STAI Terpadu Yogyakarta
9. STAI Sunan Pandanaran Yogyakarta
10. STAI Wonosari Yogyakarta
11. STIT Madani
12. STEI Yogyakarta
13. STEI Hamfara Yogyakarta
14. STEBI Al-Muhsin Yogyakarta
15. STAI Masjid Syuhada Yogyakarta
16. STPI Bina Insan Mulia Yogyakarta